Moss Data Availablity Matrix

Complied and maintained by C. La Farge


** Note that this represents a very preliminary draft. Not all columns are included and many entries are incomplete. Priority assignments are considered provisional. We welcome any and all feedback (send to clafarge@gpu.srv.ualberta.ca).

The families are listed alphabetically within the classes following Vitt (1984), Vitt et al. (1998). Vitt's classification of the genera has been modified for a number of families: Pottiaceae Zander (1983), Rhacitheciaceae (Goffinet 1997), Fabroniaceae (Buck 1981).

This Matrix includes 5 levels of priority:

  1. selected taxa to represent the major lineages of mosses (classes)
  2. taxa to represent the orders or suborders, taxa easily sampled (17)
  3. 30 major families represented
  4. All major families (84) represented by 2 species
  5. Monotypic families, all families represented
The exemplars for the first two categories were chosen based on ease of identification and sampling. The taxa for the next three categories were selected on either their presumed basal phylogenetic position, lack of taxonomic problems, or widespread distribution. Any modifications to the selection of taxa to represent the various families or to priority level are welcomed.

For the morphological data, preliminary columns have been outlined and some sample entries are shown (under the peristome development and blepharoplast columns) for how the entries should look. We would greatly appreciate any suggestions and additions for this part of the matrix.

**Note: The accession numbers are placed in the same order as the columnar order of genomic regions.

Acknowledgments to:

Bill Buck
Virginia Bryan
Ingrid Capesius
Russell Chapman
Cymon Cox
Efrain De Luna
Bernard Goffinet
Terry Hedderson
Jaakko Hyvvnen
Catherine La Farge
James Manhart
Brent Mishler
Angela Newton
Ron Pursell
Yin-Long Qui
Stephan Schaffer
Jon Shaw
Michael Stech
Dale Vitt
Allison Withey

Moss Data Availablity Matrix:

Taxon

PRIORITY

DIVERS

specimen

Herb

Contact

Access

rRNA

cpDNA

cpDNA

cpDNA

nDNA

nDNA

PERIST

Morphology

BLEPHAROBLAST

SPERM

SPORE

SPORE

SPORE

SPORE

 

 

 

 

FAM/GEN

 

Voucher

Person

number

18S

rps4

trnL

rbcL

ITS

26S

DEV/ORN

 

 

WHOLE

SEM

TEM

DEV

GERM

 

 

 

 

 

 

 

 

Genbank

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

SPORLING

 

 

 

 

 

 

 

 

EMBL

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

SPHAGNOPSIDA

 

1

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Sphagnaceae

 

1

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Sphagnum cuspidatum

3

 

 

 

Capesius

X80213*

x

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Sphagnum palustre

1

 

Qui 94018

Indiana

Chapman

 

x

 

 

 

 

 

 

 

Dukett & Carothers 1979

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

ANDREAOPSIDA

 

3

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Andreaeaceae

 

1

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Andreaea rothii

1

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Andreaea rupestris

3

 

Hedderson 10439

RNG

Chapman

U18490

x

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Andreaeobryaceae

 

1

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Andeaeobryum macrospora

2

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Takakiaceae

 

2

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Takakia lepidozioides

1

 

Schofield

UBC

Chapman

U18526

x

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

POLYTRICHOPSIDA

 

3

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Buxbaumiaceae

 

5

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Buxbaumia aphylla

2

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Diphyscium foliosum

2

 

Soderstrom SN 24/7/96

RNG

Cox/ Hedderson

 

x

x

x

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Anderson & OToole 24708; Anderson 24714

DUKE

Shaw

 

 

 

 

 

 

 

Shaw et al. 1987

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Polytrichaceae

 

21

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Polytrichum commune

1

 

?

?

?

 

 

 

 

x

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Hedderson 10458

RNG

Chapman

U18518

x

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Polytrichum juniperinum

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Paolillo & al. 1986a

 

 

 

 

 

 

Alophosia azorica

3

 

Rumsey SN

RNG

Cox/ Hedderson

 

x

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Tetraphidaceae

 

2

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Tetraphis pellucida

2

 

Hedderson 10454

RNG

Chapman

U18527

x

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Anderson & Mishler 24,533; Anderson & O'Toole 24711

DUKE

Shaw

 

 

 

 

 

 

 

Shaw & Anderson 1988

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

BRYOPSIDA

 

84

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Amblystegiaceae

 

22

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Amblystegium serpens

 

 

Marcotte 8551

MICH

Shaw

 

 

 

 

 

 

 

Shaw & Rohrer 1984

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Cox/Newton

 

 

x

x

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

?

 

DeLuna/Mishler

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Calliergonella cuspidata

3

 

Stech

HEID

Capesius/ Stech

X94257

x

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Calliergon giganteum

4

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Archidiaceae

 

1

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Archidium stellatum

5

 

?

 

Mishler

 

 

 

 

x

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Archidium tennerimum

5

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Brown & Carothers 1986

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Aulacomniaceae

 

1

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Aulacomnium androgynum

 

 

Cox 149

RNG

Cox/ Hedderson

AF023688; AF023811;AF023728

x

x

x

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Aulacomnium palustre

4

 

Garriguees

MICH

Shaw

 

 

 

 

 

 

 

Shaw & Rohrer 1984

 

 

 

 

 

 

 

 

Aulacomnium heterostichum

5

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Blomquist &Robertson 1941

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Bartramiaceae

 

9

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Bartramia stricta

3

 

Longton 4871

RNG

Cox/ Hedderson

AF023698;AF023799;AF023756

x

x

x

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Bartramia crispata

4

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Saito &Shimoze 1955

 

 

 

 

 

 

 

 

Philonotis fontana

2

 

Cox 117

RNG

Cox/ Hedderson

AF023694;AF023801;AF023758

x

x

x

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Brachytheciaceae

 

35

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Brachythecium rutabulum

3

 

Qiu 94071

UCB

Chapman

 

x

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Stech

HEID

Capesius/ Stech

X94256

x

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Hedderson 11763

RNG

Cox/ Hedderson

AF023713;AF023818;AF023772

x

x

x

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Kindbergia praelongum

4

 

Hedderson 11765

RNG

Cox/ Hedderson

 

x

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Eurhynchium pulchellum

4

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Bryaceae

 

20

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Brachymenium pulchrum

4

 

Perold

LSU

 

 

x

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Swartz 2730

RNG

 

 

x

x

x

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Bryum alpinum

4

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Bryum bicolor

2

 

Shaw sn, 1986, Shaw sn 1986

DUKE

Shaw

 

 

 

 

 

 

 

Shaw et al. 1989

 

 

 

 

 

 

 

 

Pohlia nutans

3

 

Hedderson 10481 & 8869

RNG

Cox/ Hedderson

 

 

x

x

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Rhodobryum roseum

3

 

Hedderson SN

RNG

Cox/ Hedderson

 

 

x

x

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Bryobartramiaceae

 

1

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Bryobartramia robinsii

5

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Bryoxiphiaceae

 

1

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Bryoxiphium norvegicum

5

 

Wallace SN 83

RNG

Cox/ Hedderson

 

 

x

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Calomniaceae

 

1

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Calomnion laetum

5

 

Vitt 29964

ALTA

Chapman

 

x

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Calymperaceae

 

11

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Syrrhopodon fimbriatulus

3

 

?

?

Mishler

 

 

 

 

x

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Octoblepharum albidum

4

 

?

?

Mishler

 

 

 

 

x